大腸菌は、哺乳類や鳥類の主に大腸に生息している細菌で、菌の表面にある抗原（O抗原と呼びます）によって約180種類に分類されます。殆どの大腸菌は、例えヒトの大腸内にあっても無害ですが、一部にヒトに対して病原性を示すものがあります。